上写真＝ホームで柏と引き分けた湘南がプレイオフステージ進出を決めた（写真◎J.LEAGUE）
B組の残り1枠は神戸がつかむ！
各地で熱戦が展開され、プレイオフステージ進出の8チームが決まった。最終節を前に鹿島と札幌の突破が決まっていたAグループ以外の3グループは、最後まで展開の読めない熱闘が繰り広げられることになった。
Bグループは首位FC東京に次ぐ2位抜けを神戸、徳島、大分の3チームが争っていた。神戸は敵地で徳島は3-0と下し、自力で扉を開く。開始3分で山口蛍が先制し、期待のマシカが2ゴールをスコアして快勝した。大分もアウェーながら前半終了間際に弓場将輝がネットを揺らして先制するが、FC東京の永井謙佑にゴールを許し、1-1で引き分けた。この結果、FC東京と神戸の突破が決まった。
4チームに突破の可能性が残っていたCグループは、浦和と横浜FC、湘南と柏がそれぞれプレーオフステージ突破をかけて激突。浦和は前半に関根貴大、後半に汰木康也がネットを揺らし、横浜FCを下して首位抜けを決めた。湘南は池田昌生が先制し、リードを奪ったものの、柏の猛攻に苦しめられる。だが、GK富居大樹が好セーブを連発。アディショナルタイムに高橋峻希に決められたが、1-1で試合をクローズさせ、グループ突破を成し遂げた。
以下は、最終節を終えた各グループの順位表だ。
■Aグループ順位表（勝ち点/勝敗/得失点）
1 鹿島（勝ち点12/3勝3分け0敗/10）★
2 札幌（勝ち点11/3勝2分け1敗/3）★
3 福岡（勝ち点8/2勝2分け2敗/-1）
4 鳥栖（勝ち点1/0勝1分け5敗/-12）
■Bグループ順位表（勝ち点/勝敗/得失点）
1 FC東京（勝ち点12/3勝3分け0敗/4）★
2 神戸（勝ち点8/2勝2分け2敗/2）★
3 大分（勝ち点6/1勝3分け2敗/-2）
4 徳島（勝ち点5/1勝2分け3敗/-4）
■Cグループ順位表（勝ち点/勝敗/得失点）
1 浦和（勝ち点9/2勝3分け1敗/2）★
2 湘南（勝ち点8/1勝5分け0敗/1）★
3 横浜FC（勝ち点7/2勝1分け3敗/-1）
4 柏（勝ち点6/1勝3分け2敗/-2）
■Dグループ順位表（勝ち点/勝敗/得失点）
1 横浜FM（勝ち点14/4勝2分け0敗/13）★
2 清水（勝ち点8/2勝2分け2敗/-1）★
3 仙台（勝ち点6/2勝0分け4敗/-4）
4 広島（勝ち点5/1勝2分け3敗/-8）
★＝プレーオフステージ進出
グループステージを勝ち上がった8チームが6月2日に始まるプレーオフステージに進出。ホーム＆アウェー方式の2試合を戦い、プレーオフ勝者4チームがプライムステージに駒を進めることとなる。続くプライムステージでは、勝ち上がった4チームに、ACL出場している4チーム（川崎Ｆ、Ｇ大阪、名古屋、Ｃ大阪）を加えた計8チームがホーム＆アウェー方式のトーナメントで対戦（決勝は1試合のみ）。順に準々決勝（9月1日／9月5日）、準決勝（10月6日／10月10日）、決勝（10月30日）を戦う。なお、プライムステージの対戦カードは、プレーオフステージ終了後の抽選で決定することになっている。
グループステージ第6節の結果（2021年5月19日 ）
▼Aグループ（@札幌ド/観衆2,829人）
札幌 0-0 鹿島
得点:なし
▼Aグループ（@ベススタ/観衆979人）
福岡 4-1 鳥栖
得点:（福）城後寿2、石津大介、フアンマ・デルガド
（鳥）林大地
▼Bグループ（@味スタ/観衆2,842人）
FC東京 1-1 大分
得点:（F）永井謙佑 （大）弓場将輝
▼Bグループ（@鳴門大塚/観衆3,448人）
徳島 0-3 神戸
得点:（神）山口蛍、アユブ・マシカ2
▼Cグループ（@埼玉スタ/観衆4,252人）
浦和 2-0 横浜FC
得点:（浦）関根貴大、汰木康也
▼Cグループ（@レモンS/観衆3,521人）
湘南 1-1 柏
得点:（湘）池田昌生 （柏）高橋峻希
▼Dグループ（@ユアスタ/観衆1,560人）
仙台 3-0 広島
得点:（仙）佐々木匠、加藤千尋、マルティノス
▼Dグループ（@ニッパツ/観衆4,363人）
横浜FM 5-1 清水
得点:（横）樺山諒乃介2、和田拓也、仲川輝人、レオ・セアラ
（清）片山瑛一